Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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