Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
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