Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM29Q14134 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
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