Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDE1CQ14123 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
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