Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCINQ13939 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCINQ13939 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCINQ13939 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCINQ13939 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCINQ13939 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CCINQ13939 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCINQ13939 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCINQ13939 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCINQ13939 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCINQ13939 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCINQ13939 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCINQ13939 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCINQ13939 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCINQ13939 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCINQ13939 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCINQ13939 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCINQ13939 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCINQ13939 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCINQ13939 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCINQ13939 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCINQ13939 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCINQ13939 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCINQ13939 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCINQ13939 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCINQ13939 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCINQ13939 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCINQ13939 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCINQ13939 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCINQ13939 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCINQ13939 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCINQ13939 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCINQ13939 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCINQ13939 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCINQ13939 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCINQ13939 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCINQ13939 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCINQ13939 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCINQ13939 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCINQ13939 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCINQ13939 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCINQ13939 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCINQ13939 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCINQ13939 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCINQ13939 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCINQ13939 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCINQ13939 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCINQ13939 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCINQ13939 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCINQ13939 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCINQ13939 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCINQ13939 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCINQ13939 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCINQ13939 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCINQ13939 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCINQ13939 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCINQ13939 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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CCINQ13939 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCINQ13939 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCINQ13939 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCINQ13939 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCINQ13939 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCINQ13939 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCINQ13939 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCINQ13939 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCINQ13939 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCINQ13939 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCINQ13939 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCINQ13939 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCINQ13939 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCINQ13939 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCINQ13939 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCINQ13939 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
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CCINQ13939 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CCINQ13939 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCINQ13939 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCINQ13939 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCINQ13939 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCINQ13939 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCINQ13939 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCINQ13939 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCINQ13939 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCINQ13939 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCINQ13939 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCINQ13939 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCINQ13939 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCINQ13939 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCINQ13939 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCINQ13939 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CCINQ13939 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CCINQ13939 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CCINQ13939 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCINQ13939 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCINQ13939 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCINQ13939 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCINQ13939 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCINQ13939 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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