Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PKP1Q13835 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
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