Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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