Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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ITGA7Q13683 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ITGA7Q13683 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ITGA7Q13683 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ITGA7Q13683 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ITGA7Q13683 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ITGA7Q13683 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ITGA7Q13683 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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ITGA7Q13683 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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ITGA7Q13683 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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ITGA7Q13683 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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ITGA7Q13683 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ITGA7Q13683 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ITGA7Q13683 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ITGA7Q13683 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ITGA7Q13683 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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ITGA7Q13683 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ITGA7Q13683 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ITGA7Q13683 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ITGA7Q13683 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ITGA7Q13683 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ITGA7Q13683 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ITGA7Q13683 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ITGA7Q13683 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ITGA7Q13683 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ITGA7Q13683 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ITGA7Q13683 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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ITGA7Q13683 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ITGA7Q13683 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ITGA7Q13683 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ITGA7Q13683 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ITGA7Q13683 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ITGA7Q13683 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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ITGA7Q13683 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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ITGA7Q13683 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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ITGA7Q13683 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ITGA7Q13683 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
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ITGA7Q13683 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ITGA7Q13683 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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ITGA7Q13683 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
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ITGA7Q13683 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ITGA7Q13683 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ITGA7Q13683 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
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ITGA7Q13683 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ITGA7Q13683 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ITGA7Q13683 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ITGA7Q13683 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ITGA7Q13683 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ITGA7Q13683 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ITGA7Q13683 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ITGA7Q13683 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ITGA7Q13683 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ITGA7Q13683 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ITGA7Q13683 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ITGA7Q13683 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ITGA7Q13683 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ITGA7Q13683 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ITGA7Q13683 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ITGA7Q13683 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
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