Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NAE1Q13564 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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