Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
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PKD2Q13563 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
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PKD2Q13563 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
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PKD2Q13563 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
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PKD2Q13563 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
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PKD2Q13563 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PKD2Q13563 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
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