Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms