Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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