Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIGQ13278 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIGQ13278 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIGQ13278 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIGQ13278 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIGQ13278 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RIGQ13278 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RIGQ13278 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RIGQ13278 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RIGQ13278 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RIGQ13278 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RIGQ13278 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RIGQ13278 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
RIGQ13278 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RIGQ13278 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RIGQ13278 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RIGQ13278 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RIGQ13278 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RIGQ13278 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RIGQ13278 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RIGQ13278 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RIGQ13278 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
RIGQ13278 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RIGQ13278 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RIGQ13278 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RIGQ13278 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RIGQ13278 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RIGQ13278 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RIGQ13278 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RIGQ13278 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RIGQ13278 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RIGQ13278 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
RIGQ13278 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RIGQ13278 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RIGQ13278 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RIGQ13278 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RIGQ13278 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RIGQ13278 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
RIGQ13278 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RIGQ13278 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RIGQ13278 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RIGQ13278 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RIGQ13278 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RIGQ13278 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RIGQ13278 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RIGQ13278 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RIGQ13278 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIGQ13278 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIGQ13278 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIGQ13278 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIGQ13278 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIGQ13278 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIGQ13278 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIGQ13278 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIGQ13278 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIGQ13278 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIGQ13278 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIGQ13278 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIGQ13278 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIGQ13278 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIGQ13278 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIGQ13278 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIGQ13278 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIGQ13278 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIGQ13278 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIGQ13278 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
RIGQ13278 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIGQ13278 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIGQ13278 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIGQ13278 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIGQ13278 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIGQ13278 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIGQ13278 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIGQ13278 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIGQ13278 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIGQ13278 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIGQ13278 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIGQ13278 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
RIGQ13278 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIGQ13278 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIGQ13278 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIGQ13278 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIGQ13278 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIGQ13278 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIGQ13278 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIGQ13278 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIGQ13278 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIGQ13278 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIGQ13278 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIGQ13278 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIGQ13278 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIGQ13278 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIGQ13278 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RIGQ13278 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC14□□□□□ -0.17
RIGQ13278 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RIGQ13278 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RIGQ13278 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RIGQ13278 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RIGQ13278 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RIGQ13278 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
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