Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
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