Protein–RNA interactions for Protein: Q13233

MAP3K1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K1Q13233 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MAP3K1Q13233 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MAP3K1Q13233 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MAP3K1Q13233 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MAP3K1Q13233 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MAP3K1Q13233 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MAP3K1Q13233 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MAP3K1Q13233 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MAP3K1Q13233 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MAP3K1Q13233 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MAP3K1Q13233 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MAP3K1Q13233 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
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MAP3K1Q13233 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MAP3K1Q13233 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MAP3K1Q13233 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MAP3K1Q13233 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MAP3K1Q13233 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
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MAP3K1Q13233 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MAP3K1Q13233 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MAP3K1Q13233 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
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MAP3K1Q13233 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
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MAP3K1Q13233 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
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MAP3K1Q13233 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MAP3K1Q13233 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
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MAP3K1Q13233 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
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MAP3K1Q13233 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MAP3K1Q13233 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
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MAP3K1Q13233 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MAP3K1Q13233 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MAP3K1Q13233 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MAP3K1Q13233 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MAP3K1Q13233 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MAP3K1Q13233 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MAP3K1Q13233 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MAP3K1Q13233 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
MAP3K1Q13233 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MAP3K1Q13233 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MAP3K1Q13233 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MAP3K1Q13233 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MAP3K1Q13233 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MAP3K1Q13233 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MAP3K1Q13233 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MAP3K1Q13233 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MAP3K1Q13233 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms