Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms