Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFX1Q12986 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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