Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms