Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
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