Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
STX4Q12846 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
STX4Q12846 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
STX4Q12846 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
STX4Q12846 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
STX4Q12846 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
STX4Q12846 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
STX4Q12846 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
STX4Q12846 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
STX4Q12846 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
STX4Q12846 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
STX4Q12846 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
STX4Q12846 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
STX4Q12846 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
STX4Q12846 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
STX4Q12846 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
STX4Q12846 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
STX4Q12846 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
STX4Q12846 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
STX4Q12846 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
STX4Q12846 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
STX4Q12846 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
STX4Q12846 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
STX4Q12846 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
STX4Q12846 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
STX4Q12846 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
STX4Q12846 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
STX4Q12846 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
STX4Q12846 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
STX4Q12846 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
STX4Q12846 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
STX4Q12846 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
STX4Q12846 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
STX4Q12846 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
STX4Q12846 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
STX4Q12846 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
STX4Q12846 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
STX4Q12846 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
STX4Q12846 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
STX4Q12846 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
STX4Q12846 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
STX4Q12846 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
STX4Q12846 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
STX4Q12846 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
STX4Q12846 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
STX4Q12846 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
STX4Q12846 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
STX4Q12846 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
STX4Q12846 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
STX4Q12846 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
STX4Q12846 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
STX4Q12846 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
STX4Q12846 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
STX4Q12846 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
STX4Q12846 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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STX4Q12846 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
STX4Q12846 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
STX4Q12846 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
STX4Q12846 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
STX4Q12846 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STX4Q12846 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
STX4Q12846 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STX4Q12846 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
STX4Q12846 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STX4Q12846 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STX4Q12846 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STX4Q12846 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STX4Q12846 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
STX4Q12846 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STX4Q12846 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
STX4Q12846 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STX4Q12846 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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STX4Q12846 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STX4Q12846 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
STX4Q12846 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STX4Q12846 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STX4Q12846 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STX4Q12846 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
STX4Q12846 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STX4Q12846 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STX4Q12846 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
STX4Q12846 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
STX4Q12846 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
STX4Q12846 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
STX4Q12846 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
STX4Q12846 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
STX4Q12846 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
STX4Q12846 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
STX4Q12846 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
STX4Q12846 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
STX4Q12846 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
STX4Q12846 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
STX4Q12846 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
STX4Q12846 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
STX4Q12846 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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