Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TFCP2Q12800 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TFCP2Q12800 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TFCP2Q12800 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TFCP2Q12800 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFCP2Q12800 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFCP2Q12800 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFCP2Q12800 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFCP2Q12800 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFCP2Q12800 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFCP2Q12800 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFCP2Q12800 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TFCP2Q12800 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TFCP2Q12800 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFCP2Q12800 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TFCP2Q12800 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TFCP2Q12800 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFCP2Q12800 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFCP2Q12800 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFCP2Q12800 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFCP2Q12800 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFCP2Q12800 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFCP2Q12800 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFCP2Q12800 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFCP2Q12800 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFCP2Q12800 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFCP2Q12800 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TFCP2Q12800 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms