Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
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ARHGEF5Q12774 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
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ARHGEF5Q12774 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
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ARHGEF5Q12774 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
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ARHGEF5Q12774 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
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ARHGEF5Q12774 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
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ARHGEF5Q12774 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARHGEF5Q12774 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARHGEF5Q12774 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARHGEF5Q12774 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARHGEF5Q12774 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
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