Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NIPAL4Q0D2K0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms