Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms