Protein–RNA interactions for Protein: Q08426

EHHADH, Peroxisomal bifunctional enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHHADHQ08426 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EHHADHQ08426 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms