Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms