Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms