Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBQ06643 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBQ06643 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBQ06643 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBQ06643 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBQ06643 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBQ06643 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBQ06643 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBQ06643 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBQ06643 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBQ06643 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBQ06643 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBQ06643 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBQ06643 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBQ06643 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBQ06643 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBQ06643 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBQ06643 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBQ06643 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBQ06643 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBQ06643 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBQ06643 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBQ06643 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBQ06643 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBQ06643 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBQ06643 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBQ06643 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBQ06643 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBQ06643 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBQ06643 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBQ06643 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBQ06643 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBQ06643 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBQ06643 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LTBQ06643 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LTBQ06643 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LTBQ06643 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LTBQ06643 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LTBQ06643 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LTBQ06643 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LTBQ06643 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LTBQ06643 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LTBQ06643 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LTBQ06643 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LTBQ06643 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LTBQ06643 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LTBQ06643 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LTBQ06643 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LTBQ06643 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LTBQ06643 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LTBQ06643 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LTBQ06643 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LTBQ06643 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LTBQ06643 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LTBQ06643 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LTBQ06643 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LTBQ06643 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LTBQ06643 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LTBQ06643 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LTBQ06643 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LTBQ06643 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBQ06643 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBQ06643 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBQ06643 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBQ06643 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBQ06643 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBQ06643 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBQ06643 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBQ06643 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBQ06643 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBQ06643 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBQ06643 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBQ06643 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBQ06643 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBQ06643 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBQ06643 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBQ06643 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBQ06643 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBQ06643 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBQ06643 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBQ06643 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBQ06643 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBQ06643 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBQ06643 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBQ06643 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBQ06643 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBQ06643 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBQ06643 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBQ06643 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBQ06643 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBQ06643 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBQ06643 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBQ06643 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBQ06643 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBQ06643 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBQ06643 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBQ06643 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBQ06643 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBQ06643 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBQ06643 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms