Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms