Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms