Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms