Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms