Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms