Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms