Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRX6P78412 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRX6P78412 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRX6P78412 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRX6P78412 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRX6P78412 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRX6P78412 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRX6P78412 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRX6P78412 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRX6P78412 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRX6P78412 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRX6P78412 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
IRX6P78412 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
IRX6P78412 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRX6P78412 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRX6P78412 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRX6P78412 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRX6P78412 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRX6P78412 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRX6P78412 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRX6P78412 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
IRX6P78412 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
IRX6P78412 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRX6P78412 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRX6P78412 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRX6P78412 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRX6P78412 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRX6P78412 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRX6P78412 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRX6P78412 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRX6P78412 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRX6P78412 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRX6P78412 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRX6P78412 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRX6P78412 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRX6P78412 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRX6P78412 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRX6P78412 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRX6P78412 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
IRX6P78412 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
IRX6P78412 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRX6P78412 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRX6P78412 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRX6P78412 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRX6P78412 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRX6P78412 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRX6P78412 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRX6P78412 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRX6P78412 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IRX6P78412 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IRX6P78412 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IRX6P78412 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IRX6P78412 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IRX6P78412 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IRX6P78412 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
IRX6P78412 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IRX6P78412 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IRX6P78412 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IRX6P78412 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IRX6P78412 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IRX6P78412 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IRX6P78412 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IRX6P78412 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IRX6P78412 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IRX6P78412 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IRX6P78412 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
IRX6P78412 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
IRX6P78412 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IRX6P78412 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IRX6P78412 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IRX6P78412 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IRX6P78412 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IRX6P78412 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
IRX6P78412 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
IRX6P78412 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
IRX6P78412 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IRX6P78412 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IRX6P78412 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IRX6P78412 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IRX6P78412 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IRX6P78412 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IRX6P78412 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IRX6P78412 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
IRX6P78412 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
IRX6P78412 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IRX6P78412 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IRX6P78412 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IRX6P78412 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IRX6P78412 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
IRX6P78412 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IRX6P78412 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IRX6P78412 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IRX6P78412 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IRX6P78412 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IRX6P78412 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IRX6P78412 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IRX6P78412 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRX6P78412 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
IRX6P78412 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRX6P78412 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms