Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms