Protein–RNA interactions for Protein: P63267

ACTG2, Actin, gamma-enteric smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG2P63267 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTG2P63267 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTG2P63267 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTG2P63267 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTG2P63267 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTG2P63267 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTG2P63267 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTG2P63267 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTG2P63267 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTG2P63267 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms