Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms