Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms