Protein–RNA interactions for Protein: P61019

RAB2A, Ras-related protein Rab-2A, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2AP61019 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB2AP61019 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms