Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 361.9 ms