Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BRPF1P55201 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms