Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LUMP51884 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LUMP51884 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LUMP51884 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LUMP51884 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LUMP51884 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LUMP51884 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LUMP51884 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LUMP51884 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LUMP51884 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LUMP51884 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LUMP51884 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LUMP51884 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LUMP51884 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LUMP51884 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LUMP51884 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LUMP51884 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LUMP51884 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LUMP51884 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LUMP51884 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LUMP51884 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LUMP51884 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LUMP51884 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LUMP51884 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LUMP51884 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LUMP51884 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LUMP51884 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LUMP51884 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LUMP51884 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LUMP51884 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LUMP51884 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LUMP51884 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LUMP51884 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LUMP51884 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LUMP51884 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LUMP51884 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LUMP51884 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LUMP51884 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LUMP51884 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LUMP51884 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LUMP51884 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LUMP51884 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LUMP51884 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LUMP51884 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LUMP51884 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LUMP51884 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LUMP51884 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LUMP51884 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LUMP51884 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LUMP51884 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LUMP51884 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LUMP51884 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LUMP51884 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LUMP51884 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LUMP51884 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LUMP51884 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LUMP51884 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LUMP51884 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LUMP51884 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LUMP51884 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LUMP51884 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LUMP51884 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LUMP51884 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LUMP51884 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LUMP51884 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LUMP51884 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LUMP51884 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LUMP51884 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LUMP51884 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LUMP51884 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LUMP51884 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LUMP51884 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LUMP51884 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LUMP51884 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LUMP51884 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LUMP51884 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LUMP51884 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LUMP51884 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LUMP51884 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LUMP51884 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LUMP51884 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LUMP51884 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LUMP51884 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LUMP51884 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LUMP51884 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LUMP51884 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LUMP51884 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LUMP51884 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LUMP51884 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LUMP51884 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LUMP51884 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LUMP51884 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LUMP51884 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LUMP51884 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LUMP51884 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LUMP51884 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LUMP51884 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LUMP51884 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LUMP51884 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LUMP51884 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms