Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RORCP51449 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RORCP51449 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RORCP51449 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RORCP51449 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RORCP51449 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RORCP51449 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RORCP51449 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RORCP51449 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RORCP51449 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RORCP51449 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RORCP51449 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RORCP51449 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RORCP51449 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RORCP51449 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RORCP51449 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RORCP51449 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RORCP51449 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RORCP51449 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RORCP51449 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RORCP51449 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RORCP51449 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RORCP51449 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RORCP51449 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RORCP51449 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RORCP51449 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RORCP51449 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RORCP51449 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RORCP51449 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RORCP51449 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RORCP51449 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RORCP51449 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RORCP51449 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RORCP51449 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RORCP51449 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RORCP51449 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RORCP51449 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RORCP51449 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RORCP51449 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RORCP51449 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RORCP51449 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RORCP51449 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RORCP51449 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RORCP51449 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RORCP51449 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RORCP51449 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RORCP51449 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RORCP51449 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RORCP51449 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RORCP51449 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RORCP51449 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RORCP51449 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RORCP51449 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RORCP51449 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RORCP51449 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RORCP51449 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RORCP51449 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RORCP51449 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RORCP51449 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RORCP51449 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RORCP51449 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RORCP51449 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RORCP51449 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RORCP51449 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RORCP51449 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RORCP51449 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RORCP51449 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RORCP51449 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RORCP51449 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RORCP51449 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RORCP51449 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RORCP51449 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RORCP51449 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RORCP51449 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RORCP51449 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RORCP51449 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RORCP51449 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RORCP51449 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RORCP51449 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RORCP51449 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RORCP51449 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RORCP51449 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RORCP51449 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RORCP51449 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RORCP51449 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RORCP51449 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RORCP51449 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RORCP51449 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RORCP51449 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RORCP51449 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RORCP51449 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RORCP51449 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RORCP51449 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RORCP51449 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RORCP51449 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RORCP51449 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RORCP51449 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RORCP51449 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RORCP51449 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RORCP51449 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms