Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERFP50548 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERFP50548 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERFP50548 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERFP50548 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERFP50548 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERFP50548 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERFP50548 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERFP50548 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERFP50548 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERFP50548 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERFP50548 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERFP50548 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ERFP50548 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERFP50548 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERFP50548 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERFP50548 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERFP50548 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERFP50548 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERFP50548 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERFP50548 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERFP50548 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERFP50548 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERFP50548 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERFP50548 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERFP50548 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERFP50548 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERFP50548 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERFP50548 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ERFP50548 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERFP50548 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERFP50548 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ERFP50548 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERFP50548 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERFP50548 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERFP50548 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERFP50548 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERFP50548 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERFP50548 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERFP50548 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ERFP50548 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERFP50548 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERFP50548 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERFP50548 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERFP50548 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERFP50548 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERFP50548 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERFP50548 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERFP50548 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERFP50548 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERFP50548 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERFP50548 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERFP50548 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERFP50548 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERFP50548 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERFP50548 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERFP50548 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERFP50548 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERFP50548 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERFP50548 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERFP50548 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERFP50548 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERFP50548 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERFP50548 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERFP50548 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERFP50548 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERFP50548 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERFP50548 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERFP50548 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERFP50548 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERFP50548 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERFP50548 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ERFP50548 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERFP50548 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERFP50548 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERFP50548 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERFP50548 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERFP50548 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERFP50548 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERFP50548 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERFP50548 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERFP50548 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERFP50548 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERFP50548 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERFP50548 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERFP50548 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERFP50548 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERFP50548 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERFP50548 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERFP50548 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERFP50548 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERFP50548 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERFP50548 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ERFP50548 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERFP50548 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERFP50548 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ERFP50548 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERFP50548 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERFP50548 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERFP50548 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms