Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms