Protein–RNA interactions for Protein: P42857

NSG1, Neuron-specific protein family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSG1P42857 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NSG1P42857 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NSG1P42857 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NSG1P42857 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NSG1P42857 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NSG1P42857 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NSG1P42857 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NSG1P42857 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NSG1P42857 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NSG1P42857 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NSG1P42857 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NSG1P42857 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NSG1P42857 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NSG1P42857 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NSG1P42857 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NSG1P42857 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NSG1P42857 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NSG1P42857 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NSG1P42857 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NSG1P42857 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NSG1P42857 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NSG1P42857 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NSG1P42857 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NSG1P42857 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NSG1P42857 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NSG1P42857 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NSG1P42857 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NSG1P42857 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NSG1P42857 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NSG1P42857 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NSG1P42857 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NSG1P42857 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NSG1P42857 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NSG1P42857 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NSG1P42857 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NSG1P42857 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NSG1P42857 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NSG1P42857 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NSG1P42857 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NSG1P42857 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NSG1P42857 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NSG1P42857 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NSG1P42857 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NSG1P42857 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NSG1P42857 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NSG1P42857 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NSG1P42857 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NSG1P42857 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NSG1P42857 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NSG1P42857 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NSG1P42857 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NSG1P42857 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NSG1P42857 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NSG1P42857 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NSG1P42857 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NSG1P42857 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NSG1P42857 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NSG1P42857 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NSG1P42857 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NSG1P42857 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NSG1P42857 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NSG1P42857 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NSG1P42857 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NSG1P42857 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NSG1P42857 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NSG1P42857 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NSG1P42857 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NSG1P42857 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NSG1P42857 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NSG1P42857 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NSG1P42857 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NSG1P42857 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NSG1P42857 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NSG1P42857 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NSG1P42857 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NSG1P42857 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NSG1P42857 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NSG1P42857 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NSG1P42857 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NSG1P42857 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NSG1P42857 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NSG1P42857 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NSG1P42857 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NSG1P42857 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NSG1P42857 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NSG1P42857 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NSG1P42857 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NSG1P42857 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NSG1P42857 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NSG1P42857 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NSG1P42857 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NSG1P42857 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NSG1P42857 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NSG1P42857 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NSG1P42857 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NSG1P42857 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NSG1P42857 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NSG1P42857 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NSG1P42857 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NSG1P42857 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms