Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR2IP36954 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms