Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GJC1P36383 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GJC1P36383 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GJC1P36383 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GJC1P36383 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GJC1P36383 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GJC1P36383 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
GJC1P36383 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GJC1P36383 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GJC1P36383 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GJC1P36383 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
GJC1P36383 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
GJC1P36383 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GJC1P36383 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GJC1P36383 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GJC1P36383 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GJC1P36383 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GJC1P36383 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GJC1P36383 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GJC1P36383 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GJC1P36383 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GJC1P36383 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GJC1P36383 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GJC1P36383 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
GJC1P36383 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GJC1P36383 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GJC1P36383 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GJC1P36383 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GJC1P36383 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GJC1P36383 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GJC1P36383 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GJC1P36383 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GJC1P36383 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GJC1P36383 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GJC1P36383 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GJC1P36383 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GJC1P36383 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GJC1P36383 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GJC1P36383 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GJC1P36383 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GJC1P36383 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GJC1P36383 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GJC1P36383 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GJC1P36383 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GJC1P36383 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GJC1P36383 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
GJC1P36383 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GJC1P36383 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GJC1P36383 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GJC1P36383 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GJC1P36383 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
GJC1P36383 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GJC1P36383 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GJC1P36383 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GJC1P36383 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GJC1P36383 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GJC1P36383 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GJC1P36383 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GJC1P36383 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GJC1P36383 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GJC1P36383 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GJC1P36383 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GJC1P36383 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GJC1P36383 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GJC1P36383 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GJC1P36383 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GJC1P36383 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GJC1P36383 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GJC1P36383 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GJC1P36383 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GJC1P36383 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GJC1P36383 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GJC1P36383 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GJC1P36383 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GJC1P36383 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GJC1P36383 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GJC1P36383 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
GJC1P36383 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
GJC1P36383 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GJC1P36383 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GJC1P36383 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GJC1P36383 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GJC1P36383 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GJC1P36383 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GJC1P36383 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GJC1P36383 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GJC1P36383 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GJC1P36383 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GJC1P36383 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GJC1P36383 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GJC1P36383 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GJC1P36383 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GJC1P36383 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GJC1P36383 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GJC1P36383 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GJC1P36383 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GJC1P36383 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
GJC1P36383 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
GJC1P36383 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GJC1P36383 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms