Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC1P35052 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC1P35052 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC1P35052 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC1P35052 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC1P35052 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC1P35052 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC1P35052 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC1P35052 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC1P35052 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC1P35052 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC1P35052 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC1P35052 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC1P35052 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC1P35052 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC1P35052 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC1P35052 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC1P35052 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC1P35052 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC1P35052 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC1P35052 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC1P35052 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC1P35052 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC1P35052 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC1P35052 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC1P35052 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC1P35052 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC1P35052 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC1P35052 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC1P35052 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC1P35052 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC1P35052 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC1P35052 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC1P35052 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC1P35052 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC1P35052 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC1P35052 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC1P35052 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC1P35052 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC1P35052 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC1P35052 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC1P35052 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC1P35052 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC1P35052 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC1P35052 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC1P35052 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC1P35052 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC1P35052 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC1P35052 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC1P35052 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC1P35052 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC1P35052 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC1P35052 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC1P35052 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC1P35052 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC1P35052 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC1P35052 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC1P35052 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC1P35052 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC1P35052 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC1P35052 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPC1P35052 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPC1P35052 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPC1P35052 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPC1P35052 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPC1P35052 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPC1P35052 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPC1P35052 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPC1P35052 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPC1P35052 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPC1P35052 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPC1P35052 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPC1P35052 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPC1P35052 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPC1P35052 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPC1P35052 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPC1P35052 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPC1P35052 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPC1P35052 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPC1P35052 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPC1P35052 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPC1P35052 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPC1P35052 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPC1P35052 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPC1P35052 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPC1P35052 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPC1P35052 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPC1P35052 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPC1P35052 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPC1P35052 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPC1P35052 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPC1P35052 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPC1P35052 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GPC1P35052 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC1P35052 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC1P35052 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC1P35052 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC1P35052 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC1P35052 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC1P35052 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms